56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3691 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1112    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  54.93 
 
 
531 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  53.23 
 
 
537 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  51.67 
 
 
538 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  25.15 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  25.68 
 
 
526 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  25.69 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  25.69 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  25.69 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.49 
 
 
513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  25.77 
 
 
513 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  25.49 
 
 
491 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  24.51 
 
 
513 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.29 
 
 
513 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  25.1 
 
 
513 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  24.08 
 
 
520 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.33 
 
 
530 aa  87.4  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  32.9 
 
 
214 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  24.89 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  22.6 
 
 
523 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  23.04 
 
 
510 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  20.38 
 
 
508 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  20.38 
 
 
508 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.53 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  23.21 
 
 
382 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  27.09 
 
 
509 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  27.06 
 
 
558 aa  57.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  23.64 
 
 
518 aa  57.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  21.25 
 
 
510 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  27.23 
 
 
259 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  27.63 
 
 
242 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  31.65 
 
 
473 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  24.76 
 
 
532 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  22.04 
 
 
533 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  26.84 
 
 
274 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  25.79 
 
 
234 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  23.58 
 
 
547 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  27.32 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.13 
 
 
391 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  29.01 
 
 
356 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  21.83 
 
 
207 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  26.45 
 
 
250 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  24.67 
 
 
656 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  24.24 
 
 
564 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.53 
 
 
244 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  22.14 
 
 
236 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  29.01 
 
 
239 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  24.29 
 
 
202 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  24.52 
 
 
475 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.97 
 
 
474 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  25.81 
 
 
538 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  25.81 
 
 
551 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  25.27 
 
 
602 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  24.65 
 
 
249 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  30.08 
 
 
458 aa  43.9  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>