83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1772 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  100 
 
 		 536 aa  1071    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  42.94 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  42.83 
 
 		 656 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  44.64 
 
 		 547 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  41.48 
 
 		 532 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  44.89 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  42.99 
 
 		 538 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  42.99 
 
 		 551 aa  352  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  41.62 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  42.57 
 
 		 531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  42.65 
 
 		 531 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  41.32 
 
 		 556 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  42.51 
 
 		 564 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  43.4 
 
 		 529 aa  329  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  43.95 
 
 		 558 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  44.2 
 
 		 559 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  35.66 
 
 		 602 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  27.77 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  27.77 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.27 
 
 		 510 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24.86 
 
 		 523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.05 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  24.77 
 
 		 509 aa  111  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  26.08 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  23.63 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.24 
 
 		 530 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  24.78 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  21.78 
 
 		 431 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  23.91 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.52 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.93 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  21.76 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  23.12 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30.07 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  26.29 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  31.1 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  25.15 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.82 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  25.82 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  25.82 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  25.82 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.82 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  29.85 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  29.69 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  31.58 
 
 		 229 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.43 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  25.35 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.77 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  23.46 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  27.73 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  33.09 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  25.11 
 
 		 520 aa  57  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  32.39 
 
 		 356 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  24.88 
 
 		 513 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  28.93 
 
 		 249 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  33.33 
 
 		 214 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.26 
 
 		 229 aa  53.5  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  33.83 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  26.43 
 
 		 251 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  31.11 
 
 		 252 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  33.58 
 
 		 254 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  31.78 
 
 		 242 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.48 
 
 		 274 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  32.84 
 
 		 252 aa  50.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.08 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.69 
 
 		 252 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  28.03 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  32.33 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  28.95 
 
 		 252 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  29.56 
 
 		 253 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  27.44 
 
 		 234 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30 
 
 		 202 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.75 
 
 		 357 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.32 
 
 		 255 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.35 
 
 		 251 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  30.22 
 
 		 239 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  29.55 
 
 		 610 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  37.1 
 
 		 236 aa  43.9  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  31.68 
 
 		 203 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  28.24 
 
 		 237 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  26.36 
 
 		 225 aa  43.5  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>