83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2100 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  900    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  60.47 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.57 
 
 
508 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.57 
 
 
508 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  26.22 
 
 
523 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  28.43 
 
 
503 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  25.74 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  25.79 
 
 
509 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  25.83 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  26.23 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  25.1 
 
 
538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  25.1 
 
 
551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  24.45 
 
 
546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  23.29 
 
 
656 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  22.42 
 
 
529 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  23.26 
 
 
558 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  23.12 
 
 
540 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  21.34 
 
 
530 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  20.65 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  21.29 
 
 
532 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  20.24 
 
 
531 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  28.72 
 
 
559 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  26.41 
 
 
547 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  20.04 
 
 
533 aa  77  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  22.75 
 
 
556 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  25.85 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  28.65 
 
 
536 aa  67.8  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.88 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  28.08 
 
 
602 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.33 
 
 
382 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  31.33 
 
 
246 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  27.33 
 
 
259 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  25.16 
 
 
514 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  31.94 
 
 
526 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.58 
 
 
244 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  27.45 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  35.24 
 
 
242 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  32.64 
 
 
513 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  32.64 
 
 
513 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  32.64 
 
 
513 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  32.19 
 
 
513 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  32.64 
 
 
513 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  31.91 
 
 
513 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  32.64 
 
 
491 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  31.94 
 
 
513 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  30.82 
 
 
520 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.19 
 
 
207 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  35.24 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.43 
 
 
251 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  32.39 
 
 
513 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.67 
 
 
253 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  26.76 
 
 
214 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  27.21 
 
 
248 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.44 
 
 
252 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  23.08 
 
 
242 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.92 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  28.31 
 
 
235 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  25.36 
 
 
250 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.14 
 
 
257 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  25.53 
 
 
252 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  25.93 
 
 
225 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  25 
 
 
259 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  26.62 
 
 
255 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.86 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  28.41 
 
 
234 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  27.21 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  28.48 
 
 
237 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  23.87 
 
 
256 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  33.65 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  23.81 
 
 
251 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  27.78 
 
 
202 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  27.65 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  27.54 
 
 
375 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  22.92 
 
 
252 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  22.73 
 
 
239 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  31.03 
 
 
491 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  27.73 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  22.22 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.06 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  23.18 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  24.81 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  22.14 
 
 
252 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>