56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  92.66 
 
 		 531 aa  958    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  68.45 
 
 		 540 aa  693    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1044    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  42 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  42.43 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  42.65 
 
 		 536 aa  331  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  43.34 
 
 		 551 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  43.34 
 
 		 538 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  38.29 
 
 		 656 aa  316  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  41.93 
 
 		 547 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  40.43 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  38.8 
 
 		 546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  39.45 
 
 		 564 aa  291  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  40.07 
 
 		 529 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  40.83 
 
 		 559 aa  276  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  39.08 
 
 		 558 aa  266  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  40.91 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  27.61 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  27.61 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  25.97 
 
 		 503 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  25.93 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  25.93 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  25.33 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  25.74 
 
 		 509 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  22.74 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  20.97 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.67 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  30.57 
 
 		 248 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.08 
 
 		 257 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  28.85 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  32.39 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.95 
 
 		 244 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  29.41 
 
 		 249 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.68 
 
 		 382 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.46 
 
 		 392 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  32.33 
 
 		 253 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.77 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  25.45 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.07 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  35.24 
 
 		 242 aa  50.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.29 
 
 		 246 aa  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  35.83 
 
 		 242 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  29.93 
 
 		 252 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  24.05 
 
 		 236 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  33.33 
 
 		 225 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30 
 
 		 251 aa  47.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  31.16 
 
 		 234 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  22.02 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  31.13 
 
 		 235 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.56 
 
 		 229 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  30.43 
 
 		 274 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  25.81 
 
 		 491 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.92 
 
 		 254 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  43.5  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>