More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0470 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 656 aa  1357    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  56.29 
 
 		 547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  51.77 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  55.45 
 
 		 529 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  49.43 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  49.43 
 
 		 538 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  47.66 
 
 		 564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  45.14 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  45.57 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  43.78 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  47.03 
 
 		 559 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  42.64 
 
 		 536 aa  348  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  38.89 
 
 		 533 aa  348  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  40.67 
 
 		 540 aa  320  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  38.97 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  38.29 
 
 		 531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  41.48 
 
 		 602 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.29 
 
 		 510 aa  125  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.02 
 
 		 508 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.56 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.02 
 
 		 508 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 		 272 aa  120  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  27.04 
 
 		 509 aa  118  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  24.85 
 
 		 428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.71 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 263 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24.82 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  57.14 
 
 		 245 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  49.49 
 
 		 260 aa  104  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  49.49 
 
 		 260 aa  104  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  23.29 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  47.42 
 
 		 108 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.09 
 
 		 530 aa  95.5  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  46.24 
 
 		 254 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  47.67 
 
 		 261 aa  92.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  44.79 
 
 		 109 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  44.79 
 
 		 109 aa  90.9  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  44.79 
 
 		 109 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  44.79 
 
 		 110 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  42.71 
 
 		 106 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 		 110 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  27.68 
 
 		 503 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 102 aa  87  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 123 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 101 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 101 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 101 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 101 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 101 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  37 
 
 		 101 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 101 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 101 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  43.75 
 
 		 112 aa  84  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  40.62 
 
 		 110 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  40.62 
 
 		 110 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 102 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  42.71 
 
 		 109 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  37.11 
 
 		 106 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 108 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  39.58 
 
 		 110 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  46.84 
 
 		 102 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  37.76 
 
 		 107 aa  81.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  36.46 
 
 		 106 aa  81.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  47.44 
 
 		 103 aa  81.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  38.95 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  42.27 
 
 		 109 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  39.58 
 
 		 110 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 108 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  43.59 
 
 		 103 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 101 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  36.46 
 
 		 106 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 102 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  41.77 
 
 		 102 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 		 108 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 		 109 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 		 108 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 		 108 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 		 108 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  38.54 
 
 		 108 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  37.11 
 
 		 108 aa  75.5  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  35.85 
 
 		 110 aa  75.5  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  41.86 
 
 		 107 aa  75.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  42.11 
 
 		 107 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  37.89 
 
 		 107 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 106 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  38.95 
 
 		 106 aa  75.1  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  38.95 
 
 		 106 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  40.62 
 
 		 106 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  38.3 
 
 		 106 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  42.55 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  28.45 
 
 		 257 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  36.05 
 
 		 100 aa  70.5  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.77 
 
 		 236 aa  70.5  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>