More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3711 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 101 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  72.28 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  74 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  72.28 
 
 		 102 aa  156  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  71 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  76 
 
 		 101 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  75 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  74.26 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  74.26 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  74.26 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  74.26 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  76 
 
 		 101 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  75 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  75 
 
 		 101 aa  153  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  67.33 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  70.3 
 
 		 103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  51 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  54.08 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  52.08 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  52.04 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  49.5 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  49.5 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  49.5 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  59.21 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  55.1 
 
 		 109 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  48.48 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  48.51 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  60 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  46.53 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  46.53 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  46.53 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  51.02 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  52.04 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  48.45 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  46 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  47.52 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  45 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  44 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  43.56 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  42.42 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  43.43 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  43.3 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  43.3 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  43.3 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  43.3 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  42.27 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  48.05 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  42.42 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  41.67 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  38 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 272 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 656 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  43.75 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  45.95 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  35.35 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  30.39 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  33.01 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  30.39 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  26.6 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.61 
 
 		 280 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.26 
 
 		 455 aa  62  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  38.27 
 
 		 459 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 460 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  31.91 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  31.91 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  34.65 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>