More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5138 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 109 aa  227  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  78.9 
 
 		 109 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  77.06 
 
 		 109 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  76.36 
 
 		 110 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  76.36 
 
 		 110 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  76.36 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  78.3 
 
 		 106 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  76.42 
 
 		 106 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  68.87 
 
 		 110 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  67.59 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  67.92 
 
 		 110 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  52.43 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  51.89 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  51.46 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  51.4 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  51.4 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  54.26 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  52.94 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  48.6 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  48.08 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  49.04 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  47.66 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  50.5 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  50.98 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  52.43 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  50.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  52.08 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  52.04 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  52.04 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 		 102 aa  95.9  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  49.48 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  41.51 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  47.42 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  53.75 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  42.86 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  40.2 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 		 272 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  53.41 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  45 
 
 		 245 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 		 656 aa  77  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 		 263 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 		 260 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  35.24 
 
 		 260 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.78 
 
 		 393 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  34.74 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  34.07 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  39.02 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  39.02 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  37.8 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.46 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.48 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  40.21 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>