More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
110 aa  225  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  96.36 
 
 
110 aa  221  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  73.58 
 
 
109 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  74.77 
 
 
110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  74.77 
 
 
110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  73.58 
 
 
109 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  72.9 
 
 
110 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  68.87 
 
 
109 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  70.87 
 
 
106 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  68.93 
 
 
106 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  65.71 
 
 
112 aa  153  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  50.96 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  53.92 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  48.57 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  49.52 
 
 
109 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  49.52 
 
 
109 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  49.52 
 
 
109 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  47.62 
 
 
106 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  62.5 
 
 
102 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 
101 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 
101 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  52.63 
 
 
101 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 
101 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  49.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  49.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  50.51 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  48.57 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  53.68 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  54.08 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  53.68 
 
 
101 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  53.68 
 
 
101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  53.68 
 
 
101 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  46.6 
 
 
110 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  46.23 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  53.12 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  47.17 
 
 
108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  47.17 
 
 
108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  46.53 
 
 
106 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  47.17 
 
 
108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  47.17 
 
 
108 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  49 
 
 
108 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  51.58 
 
 
102 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  50.51 
 
 
110 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
106 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  48.96 
 
 
106 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  48.35 
 
 
106 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  50 
 
 
102 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  47.42 
 
 
100 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
656 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 
272 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  48.04 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  39.09 
 
 
260 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 
260 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  36 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.46 
 
 
245 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  38.3 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  40 
 
 
254 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  31.91 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.46 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 
282 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  36.84 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 
278 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  34.74 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.68 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 
277 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
216 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  39.56 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  28.71 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.73 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
99 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.112795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  35.14 
 
 
107 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.65 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>