More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2117 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  45.53 
 
 
263 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  43.82 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  44.4 
 
 
261 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  45.34 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  44.53 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  42.86 
 
 
255 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  36.43 
 
 
272 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  36.67 
 
 
153 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1423  ankyrin  42.98 
 
 
152 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  46.39 
 
 
107 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 
656 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3944  ankyrin  35.17 
 
 
174 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0207728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  40.86 
 
 
106 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  36.73 
 
 
101 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  36.23 
 
 
1585 aa  86.7  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
101 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1462  ankyrin repeat-containing protein  40 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
101 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
101 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  40 
 
 
161 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  37.23 
 
 
106 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7751  ankyrin  37.93 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493999  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  36.17 
 
 
106 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  37.23 
 
 
106 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  43.53 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  38.1 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  44.05 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  35.79 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  30.56 
 
 
870 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  35.66 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 
102 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  44.09 
 
 
103 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
110 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  40.62 
 
 
106 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  36.17 
 
 
110 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  41.84 
 
 
112 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
110 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  44.26 
 
 
590 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  37.63 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  33.68 
 
 
108 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  37.63 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  36.57 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  37.63 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51050  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  48.05 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.018542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  43.59 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  44.59 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  32.7 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
102 aa  72  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  40.79 
 
 
107 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.59 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  42.11 
 
 
107 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  37.23 
 
 
108 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  37.23 
 
 
108 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  40.54 
 
 
108 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2048  hypothetical protein  34.86 
 
 
581 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  37.23 
 
 
108 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  37.23 
 
 
108 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  40.54 
 
 
102 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  37.23 
 
 
108 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  39.42 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  40.86 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
106 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2058  hypothetical protein  32.73 
 
 
580 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  35.11 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  36.43 
 
 
494 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  35.11 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  34.74 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  32.26 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  35.11 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  35.11 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  36.04 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  35.11 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  35.11 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  36.13 
 
 
151 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
106 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37212  predicted protein  34.13 
 
 
146 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  41.94 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  34.04 
 
 
108 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
141 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  33.07 
 
 
163 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  28.36 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  35.19 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  38.89 
 
 
790 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  37.07 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>