More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3995 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 109 aa  231  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 109 aa  231  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 109 aa  231  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  79.63 
 
 		 108 aa  192  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  68.27 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  68.87 
 
 		 108 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  68.87 
 
 		 108 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  68.87 
 
 		 108 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  68.87 
 
 		 108 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  67.92 
 
 		 108 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 108 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 108 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  66.67 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  66.67 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  65.71 
 
 		 108 aa  153  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  68.27 
 
 		 107 aa  153  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  65.71 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  63.89 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  60.38 
 
 		 106 aa  146  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  61.32 
 
 		 106 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  57.58 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  57.43 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  58.59 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  56.57 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  59.41 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  54.29 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  54.81 
 
 		 110 aa  117  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  54.81 
 
 		 110 aa  117  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  52.43 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  49.52 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  49.52 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  51.92 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  51.04 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  46.6 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  51.04 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  51.04 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  47 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  46.08 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  47.96 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  47.92 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  46.53 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  48.96 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  48.96 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  48.96 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  48.96 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  48.96 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  46.53 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  43.88 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  48.45 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  50 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  42.57 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  42.42 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  44.79 
 
 		 656 aa  90.9  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  50.5 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 263 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  40.82 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  40 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  37.63 
 
 		 254 aa  73.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  40.22 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  37.11 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.24 
 
 		 277 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 278 aa  67  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  39.13 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 480 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  37.5 
 
 		 711 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  38.46 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.46 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.46 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  38.46 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.46 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  31.11 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>