More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0429 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
110 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  95.45 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  95.45 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  89.09 
 
 
109 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  76.36 
 
 
109 aa  178  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  76.36 
 
 
109 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  77.57 
 
 
106 aa  176  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  76.64 
 
 
106 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  72.9 
 
 
110 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  71.03 
 
 
110 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  68.81 
 
 
112 aa  157  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  56.73 
 
 
107 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 
106 aa  126  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  55.77 
 
 
107 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  49.53 
 
 
106 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 
108 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  49.07 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  49.07 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  54.64 
 
 
102 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 
108 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  50.52 
 
 
101 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
101 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
101 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
101 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  49.04 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 
108 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  51.92 
 
 
109 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  51.92 
 
 
109 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  51.92 
 
 
109 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  48.15 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  50.49 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  50.52 
 
 
101 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  47.52 
 
 
106 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  50.94 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  49.48 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  51.96 
 
 
106 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 
102 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  50.51 
 
 
103 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  51.96 
 
 
106 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  47.96 
 
 
102 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  47.17 
 
 
107 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  48.51 
 
 
101 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  57.5 
 
 
110 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  47.42 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  45.36 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  43.14 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  45.56 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  44.23 
 
 
263 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  41.9 
 
 
158 aa  87  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  46.67 
 
 
103 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  38.83 
 
 
260 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
260 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 
272 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  45 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
656 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  41.05 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  36.26 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  38.14 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 
282 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  35.35 
 
 
261 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  40.86 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  34.04 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  33.66 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  34.62 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  30.21 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 
393 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
278 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>