58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1165 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1048    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  69.6 
 
 		 540 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  92.66 
 
 		 531 aa  958    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  41.93 
 
 		 533 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  42.17 
 
 		 532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  43.2 
 
 		 551 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  43.2 
 
 		 538 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  42.57 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  40.7 
 
 		 556 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  38.97 
 
 		 656 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  43.17 
 
 		 547 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  38.7 
 
 		 546 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  40.43 
 
 		 564 aa  299  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  40.3 
 
 		 529 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  41.43 
 
 		 559 aa  283  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  38.81 
 
 		 558 aa  270  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  40.61 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  25.42 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.05 
 
 		 508 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.05 
 
 		 508 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.15 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  25.64 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.16 
 
 		 518 aa  104  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  25.37 
 
 		 509 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24.14 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  22.42 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  21.13 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.96 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  31.85 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.17 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  34.46 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  28.21 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  25.31 
 
 		 502 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  30.07 
 
 		 249 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  32.54 
 
 		 259 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.79 
 
 		 236 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.45 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  36 
 
 		 242 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  29.94 
 
 		 253 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.1 
 
 		 244 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  27.44 
 
 		 246 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  34.11 
 
 		 225 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.07 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.29 
 
 		 242 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.9 
 
 		 251 aa  47.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.14 
 
 		 252 aa  47.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  25.81 
 
 		 491 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  24.44 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  28.47 
 
 		 252 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  28.78 
 
 		 221 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  27.98 
 
 		 234 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  23.91 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.52 
 
 		 229 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.83 
 
 		 255 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  25 
 
 		 513 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  32.14 
 
 		 235 aa  43.9  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>