125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0200 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  60 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  61.28 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  52.92 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  52.08 
 
 		 246 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  49.38 
 
 		 252 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  46.15 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  43.55 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  47.56 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  46.88 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  49.78 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  45.09 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  46.43 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  48.03 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  43.86 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  40.89 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  42.56 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  43.36 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  43.91 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  42.04 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  45.33 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  46.77 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  42.34 
 
 		 382 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.66 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  43.32 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  38.74 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  40.76 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  36.59 
 
 		 221 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  40.48 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  36.84 
 
 		 207 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.4 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  38.58 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  38.14 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  37.95 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.78 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  38.1 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  36.14 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.2 
 
 		 391 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  35.33 
 
 		 189 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  31.31 
 
 		 458 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  29.11 
 
 		 371 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  36.76 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  33.68 
 
 		 205 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  34.24 
 
 		 205 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  31.91 
 
 		 492 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.25 
 
 		 375 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  32.39 
 
 		 491 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  32.47 
 
 		 356 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  28.12 
 
 		 392 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  28.91 
 
 		 523 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.11 
 
 		 461 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  32.47 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  30.7 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  36.15 
 
 		 510 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  32.64 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  32.64 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  31.88 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  28.95 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  32.04 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  35.38 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  27.91 
 
 		 556 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  31.72 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.68 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  30.64 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  29.86 
 
 		 518 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  33.13 
 
 		 551 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  33.13 
 
 		 538 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.44 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.81 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  25.6 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  27.34 
 
 		 656 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  32.35 
 
 		 532 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.53 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  33.08 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  25.68 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  27.23 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  27.33 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  29.5 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.11 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  25.26 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  25.26 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  25.26 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  27.83 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  29.48 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  36.22 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  28.85 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  28.21 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  29.87 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  27.01 
 
 		 546 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  23.47 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  24.86 
 
 		 1514 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.31 
 
 		 2454 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  30.11 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.87 
 
 		 530 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  27.44 
 
 		 3021 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  25.93 
 
 		 537 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  30.69 
 
 		 602 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  24.53 
 
 		 533 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>