77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1863 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  100 
 
 
228 aa  460  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  74.89 
 
 
223 aa  288  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  58.14 
 
 
232 aa  227  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  51.47 
 
 
221 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  52.06 
 
 
221 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  50.74 
 
 
249 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  52.28 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  49.75 
 
 
222 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  50.76 
 
 
305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  51.02 
 
 
217 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  51.02 
 
 
217 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  51.02 
 
 
217 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  51.02 
 
 
217 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  51.02 
 
 
262 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  51.02 
 
 
217 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  51.24 
 
 
217 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  51.24 
 
 
217 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  51.6 
 
 
217 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  49.47 
 
 
247 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  50.5 
 
 
219 aa  165  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  47.59 
 
 
284 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  46.81 
 
 
218 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  47.18 
 
 
282 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  40.86 
 
 
218 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  40.41 
 
 
217 aa  132  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  32.64 
 
 
202 aa  115  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  33.51 
 
 
193 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  39.11 
 
 
254 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  29.95 
 
 
205 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.02 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.61 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  27.49 
 
 
250 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.33 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  35.03 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.63 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.3 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.14 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  32.38 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  30.7 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.37 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.15 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  32.16 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.14 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.95 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  34.39 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  32.2 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.51 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  31.52 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  30.82 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  31.21 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  29.75 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  26.29 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  30.64 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  30.85 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  33.51 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  30.52 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  29.89 
 
 
357 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.85 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.94 
 
 
252 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.11 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  28.26 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  28.82 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  25.13 
 
 
475 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.82 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  26.7 
 
 
474 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30.46 
 
 
356 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.78 
 
 
473 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  25.29 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  27.47 
 
 
253 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  27.5 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  28.3 
 
 
375 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.64 
 
 
461 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  28.57 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  35.71 
 
 
363 aa  42  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.07 
 
 
244 aa  41.6  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>