104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  100 
 
 		 363 aa  730    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  34.65 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  29.32 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.13 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  32.21 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.97 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  31.39 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  30.15 
 
 		 253 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.85 
 
 		 251 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  28.74 
 
 		 251 aa  85.9  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.78 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  31.49 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  29.91 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.21 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  33.03 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  31.84 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.73 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.72 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.81 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.72 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  27.02 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.71 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.23 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.84 
 
 		 252 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.68 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.23 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  29 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.71 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  26.74 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  32.88 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.88 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  28.44 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  29.47 
 
 		 207 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  30.43 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  26.5 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.95 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.86 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  27.64 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  27.78 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  29.15 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  35.66 
 
 		 152 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  32.34 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  30.52 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  29.25 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.47 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  30.34 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.31 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  28.5 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  26.52 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  29.65 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  24.39 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  32.53 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.42 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  27.39 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  22.83 
 
 		 509 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  27.51 
 
 		 508 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  27.51 
 
 		 508 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  36.5 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  27.86 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.81 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.85 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  24.85 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  25.37 
 
 		 203 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  26.55 
 
 		 203 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  28.77 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  27.16 
 
 		 491 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  29.38 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  28.48 
 
 		 510 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  26.34 
 
 		 518 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  25.23 
 
 		 218 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  28.12 
 
 		 513 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  31.47 
 
 		 656 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.93 
 
 		 513 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  27.32 
 
 		 551 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  26.02 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  28.18 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  25.93 
 
 		 513 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.93 
 
 		 513 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  25.93 
 
 		 513 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  25 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  25.93 
 
 		 513 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  30.56 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  29.03 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  27.12 
 
 		 523 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  27.98 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  26.54 
 
 		 513 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  26.54 
 
 		 520 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  30.41 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  27.87 
 
 		 354 aa  46.2  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  33.09 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  29.37 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  31.07 
 
 		 547 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  26.75 
 
 		 526 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  34.31 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  23.59 
 
 		 186 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  23.46 
 
 		 202 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  23.08 
 
 		 269 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  25.5 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>