107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0691 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  100 
 
 
356 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  31.87 
 
 
371 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  34.65 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  34.39 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.21 
 
 
391 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  31.08 
 
 
257 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.13 
 
 
392 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  30.2 
 
 
253 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.28 
 
 
382 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.29 
 
 
236 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  32.75 
 
 
252 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  37.13 
 
 
252 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  33.16 
 
 
254 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  31.19 
 
 
251 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  29.89 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  31.74 
 
 
249 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  37.23 
 
 
234 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  29.74 
 
 
221 aa  93.6  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.39 
 
 
252 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  32.47 
 
 
259 aa  89.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  32.31 
 
 
253 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.94 
 
 
214 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  34.31 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  28.83 
 
 
256 aa  85.9  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  30.05 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30.63 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  32.73 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  31.37 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  30.93 
 
 
474 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  32.99 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  29.35 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28.02 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  26.75 
 
 
252 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  34.74 
 
 
225 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33.5 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  34.41 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.63 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  31.03 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  30.09 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  30.93 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  25.07 
 
 
471 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  27.5 
 
 
523 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  26.4 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  27.51 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  30.34 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  31.96 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.26 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  27.6 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  28.86 
 
 
473 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  27.78 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  27.78 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  28.89 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.83 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.81 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  27.59 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  26.13 
 
 
207 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.65 
 
 
503 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.63 
 
 
461 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  28.97 
 
 
251 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.9 
 
 
510 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  31.34 
 
 
546 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  28.12 
 
 
217 aa  60.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.87 
 
 
236 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  27.7 
 
 
564 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
656 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  31.97 
 
 
152 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  33.91 
 
 
518 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  29.52 
 
 
532 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  24.32 
 
 
509 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  23.76 
 
 
205 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  28.64 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  34.38 
 
 
558 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  27.72 
 
 
2454 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  27.69 
 
 
189 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.54 
 
 
229 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  31.78 
 
 
559 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  27.41 
 
 
529 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  28.24 
 
 
602 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  25.73 
 
 
229 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  27.96 
 
 
538 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  27.96 
 
 
551 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  27.27 
 
 
556 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  29 
 
 
530 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  31.69 
 
 
518 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  26.37 
 
 
247 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  23.08 
 
 
3002 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  29.01 
 
 
551 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  26.03 
 
 
502 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  23.16 
 
 
3021 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  25 
 
 
341 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  32.73 
 
 
222 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  23.44 
 
 
533 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  26.15 
 
 
547 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  29.69 
 
 
537 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  19.79 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  23.18 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  19.79 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  26.32 
 
 
1514 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  25.1 
 
 
526 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>