118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6177 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  100 
 
 		 375 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25.76 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  34.39 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  36.84 
 
 		 259 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  32.88 
 
 		 382 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  32.33 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  31.13 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.65 
 
 		 234 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  35.1 
 
 		 274 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.48 
 
 		 239 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  31.76 
 
 		 246 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  35.1 
 
 		 235 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  33.01 
 
 		 257 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.72 
 
 		 251 aa  93.2  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.7 
 
 		 237 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  32.31 
 
 		 189 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.52 
 
 		 236 aa  89.4  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.36 
 
 		 214 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  30.19 
 
 		 253 aa  86.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  28.91 
 
 		 205 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.54 
 
 		 221 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  30.47 
 
 		 259 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.47 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  31.92 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.81 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.7 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  34.9 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.77 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  30.37 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  34.62 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  37.01 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  30.1 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  31.28 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  29.21 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  30.66 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.38 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.68 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  32.86 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  31.4 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  30.32 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  27.71 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  28.79 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  24.4 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  31.28 
 
 		 242 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.46 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  30.48 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  32.49 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  29.89 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  28.25 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  28.25 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  29.17 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  35.17 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  32.06 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  27.86 
 
 		 474 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  30.95 
 
 		 249 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  31.97 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  27.73 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  27.43 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  31.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  33.1 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  30.2 
 
 		 203 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.17 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  26.29 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  29.86 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  27.86 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.36 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.28 
 
 		 229 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  27.36 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  29.8 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  30.22 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  29.58 
 
 		 229 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  27.78 
 
 		 547 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 2706 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  25.54 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  30.69 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.52 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  30.37 
 
 		 518 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  27.03 
 
 		 558 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  29.07 
 
 		 218 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.57 
 
 		 2454 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  25.58 
 
 		 656 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  28.35 
 
 		 514 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  25.26 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  30.07 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  28.9 
 
 		 551 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  28.9 
 
 		 538 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  28.04 
 
 		 559 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  26.8 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  25.91 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  28.91 
 
 		 221 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  26.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  27.54 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  28.47 
 
 		 3739 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  30.23 
 
 		 529 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  24.6 
 
 		 513 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.6 
 
 		 513 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  24.6 
 
 		 513 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>