44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0919 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1231    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  29.73 
 
 
259 aa  63.9  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  30.71 
 
 
229 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.28 
 
 
382 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3717  hypothetical protein  23.66 
 
 
353 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.295306  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.17 
 
 
229 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  27.86 
 
 
375 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.61 
 
 
357 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  30.07 
 
 
564 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.08 
 
 
530 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  32.74 
 
 
529 aa  53.9  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  29.29 
 
 
214 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  26.17 
 
 
656 aa  50.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.67 
 
 
244 aa  50.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  28.48 
 
 
242 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.29 
 
 
503 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.27 
 
 
518 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  30.77 
 
 
532 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  27.15 
 
 
546 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  30.71 
 
 
246 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  26.98 
 
 
250 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  27.34 
 
 
239 aa  48.9  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  28.57 
 
 
508 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  28.57 
 
 
508 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  31.75 
 
 
551 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  28.57 
 
 
509 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  28.3 
 
 
242 aa  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  31.75 
 
 
538 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  27.86 
 
 
510 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  24.31 
 
 
202 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  20.62 
 
 
250 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  29.49 
 
 
274 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  27.63 
 
 
237 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.95 
 
 
510 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  27.27 
 
 
547 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  26.96 
 
 
475 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  26.67 
 
 
458 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  29.13 
 
 
533 aa  44.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  26.12 
 
 
556 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  23.94 
 
 
207 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  26.45 
 
 
152 aa  44.3  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  23.57 
 
 
523 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.81 
 
 
391 aa  43.9  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>