20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3717 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3717  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.295306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  22.42 
 
 
769 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  20.95 
 
 
746 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0918  hypothetical protein  28.36 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  19.81 
 
 
750 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  26.67 
 
 
757 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3689  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
753 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.763905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4208  protein of unknown function DUF181  24.01 
 
 
732 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.62 
 
 
371 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215888  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  20.64 
 
 
762 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0996  putative streptolysin associated protein SagC  27.12 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0959  group-specific protein  18.34 
 
 
641 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2436  hypothetical protein  26.93 
 
 
727 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484009  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  38.27 
 
 
752 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1164  group-specific protein  20.89 
 
 
639 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  25.63 
 
 
649 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4032  hypothetical protein  20.89 
 
 
639 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  31.4 
 
 
474 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1312  hypothetical protein  20.25 
 
 
639 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  24.58 
 
 
610 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>