19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4208 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4208  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
732 aa  1443    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3689  protein of unknown function DUF181  47.22 
 
 
753 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.763905  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2591  hypothetical protein  42.24 
 
 
726 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245728  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2436  hypothetical protein  41.37 
 
 
727 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484009  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0351  group-specific protein  23.44 
 
 
651 aa  111  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00317496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1156  hypothetical protein  23.77 
 
 
639 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1175  hypothetical protein  23.84 
 
 
639 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1268  hypothetical protein  23.84 
 
 
639 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1338  hypothetical protein  23.53 
 
 
639 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.77157e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1150  group-specific protein  23.77 
 
 
639 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0959  group-specific protein  22.25 
 
 
641 aa  99.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1416  hypothetical protein  23.11 
 
 
639 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1378  hypothetical protein  22.87 
 
 
639 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4032  hypothetical protein  22.33 
 
 
639 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1312  hypothetical protein  21.86 
 
 
639 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1164  group-specific protein  20.63 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3717  hypothetical protein  31.19 
 
 
353 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.295306  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0554  hypothetical protein  37.5 
 
 
627 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  26.61 
 
 
746 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>