60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2434 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  88.66 
 
 		 537 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1070    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  51.67 
 
 		 551 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  45.49 
 
 		 531 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  28.57 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  24.76 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  25.1 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  24.76 
 
 		 513 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.9 
 
 		 513 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  24.9 
 
 		 513 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.76 
 
 		 513 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  24.9 
 
 		 513 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  24.9 
 
 		 513 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  24.38 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  24.03 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  23.72 
 
 		 491 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  27 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  23.79 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  23.71 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  22.59 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  22.59 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  21.15 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  23.54 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  24.29 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.2 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  27.15 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.61 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.65 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  30.29 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  27.27 
 
 		 236 aa  57  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  27.65 
 
 		 242 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  29.72 
 
 		 235 aa  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.92 
 
 		 391 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  32.35 
 
 		 250 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.81 
 
 		 3002 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  27.89 
 
 		 656 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  34.34 
 
 		 274 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  25.7 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  27.51 
 
 		 556 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.82 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  28.38 
 
 		 3021 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  30.47 
 
 		 564 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.1 
 
 		 202 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  26.76 
 
 		 207 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  22.16 
 
 		 236 aa  47.4  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  25.94 
 
 		 458 aa  47  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.39 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  29.6 
 
 		 529 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  25.96 
 
 		 259 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  23.39 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  28.36 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  28.68 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  25.58 
 
 		 249 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.92 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30.28 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  28.7 
 
 		 234 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  26.58 
 
 		 252 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.19 
 
 		 356 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>