70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6188 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  90.95 
 
 		 221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  72.04 
 
 		 222 aa  322  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  71.09 
 
 		 249 aa  321  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  69.19 
 
 		 305 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  69.19 
 
 		 262 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  69.19 
 
 		 217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  69.19 
 
 		 217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  69.19 
 
 		 217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  69.19 
 
 		 217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  69.19 
 
 		 217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  71.09 
 
 		 217 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  64.62 
 
 		 217 aa  267  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  64.62 
 
 		 217 aa  267  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  54.03 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  51.47 
 
 		 228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  51.2 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  49.73 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  52.31 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  51.55 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  48.39 
 
 		 284 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  49.19 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  47.03 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  43.48 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  43.6 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  37.63 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  41.38 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  35.68 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  36.95 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  32.04 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  30.81 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  34.98 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.86 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.49 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33.17 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.78 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  34.63 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  29.27 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  32 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.68 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  30.3 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.67 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.89 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.23 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  30.7 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  26.54 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  28.64 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  27.83 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  29.85 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.41 
 
 		 382 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.6 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  32.1 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.88 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.89 
 
 		 357 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.99 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.01 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  26.9 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  27.14 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.82 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  28.37 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.89 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  28.91 
 
 		 375 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  29.81 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  32.32 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.77 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  31.48 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  24.34 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  27.14 
 
 		 3002 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>