72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5819 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  58.14 
 
 
228 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  58.02 
 
 
223 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  55.11 
 
 
249 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  50 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  51.2 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  55.37 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  49.49 
 
 
305 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  49.49 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  49.49 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  49.49 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  49.49 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  49.49 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  49.49 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  51.05 
 
 
217 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  49.49 
 
 
222 aa  177  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  50.72 
 
 
219 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  51.24 
 
 
217 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  51.24 
 
 
217 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  46.03 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  48.37 
 
 
284 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  51.16 
 
 
218 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  48.9 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  44.62 
 
 
217 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  40.91 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  43.43 
 
 
254 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  35.14 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  37.71 
 
 
193 aa  115  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  31.1 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  31.9 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.77 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  29.14 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  27.87 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.21 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.17 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.75 
 
 
382 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  27.59 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  32.66 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  27.59 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.48 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  29.28 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  33.33 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  32.1 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.56 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  33.54 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.02 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.22 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  26.24 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.41 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  30.63 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  32.32 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  30.49 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  33.33 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.73 
 
 
357 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.41 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  32.32 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  29.55 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  28.95 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.77 
 
 
259 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.13 
 
 
461 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  27.57 
 
 
371 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  34.3 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  25 
 
 
257 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  30.65 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  27.98 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  28.65 
 
 
375 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  26.83 
 
 
354 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  33.33 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  34.15 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  26.77 
 
 
356 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  26.32 
 
 
473 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>