69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5587 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  74.89 
 
 		 228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  58.02 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  54.74 
 
 		 249 aa  201  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  53.16 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  51.66 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  51.55 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  50.78 
 
 		 262 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  50.78 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  50.78 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  50.78 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  51.83 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  50.78 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  50.78 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  50.78 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  51.09 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  51.79 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  51.79 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  51.63 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  49.29 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  45.95 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  46.11 
 
 		 284 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  46.45 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  41.4 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  39.34 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  32.98 
 
 		 202 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  40.69 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  34.92 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  32.65 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  32.65 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  33.72 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  28.92 
 
 		 250 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  29.95 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.84 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  30.7 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.8 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.85 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.17 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  32.99 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  31.96 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.33 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  30.35 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  32.37 
 
 		 382 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  33.17 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  32.42 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.55 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.74 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.44 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  30.27 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.25 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  28.03 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  30.65 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  29.89 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.39 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25.7 
 
 		 371 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  27.96 
 
 		 356 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  28.12 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  30.65 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  28.49 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  32.56 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  23.2 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  28.78 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.26 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.23 
 
 		 357 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  26.11 
 
 		 473 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>