91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2877 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  100 
 
 
203 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  36.08 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  34.5 
 
 
205 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  36.5 
 
 
242 aa  98.6  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  33.33 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  34.74 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  32 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  35.92 
 
 
274 aa  89.4  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  32.6 
 
 
221 aa  88.2  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  37.44 
 
 
235 aa  87.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  36.5 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  37.11 
 
 
239 aa  85.1  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.82 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  31.96 
 
 
259 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  30.26 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.31 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.5 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  33.95 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  25.14 
 
 
246 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  29.84 
 
 
3021 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  25.4 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28.21 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  27.84 
 
 
382 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  31.29 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.82 
 
 
508 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  23.56 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.82 
 
 
508 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  24.47 
 
 
251 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  24.16 
 
 
354 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.89 
 
 
174 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  33.33 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  25.4 
 
 
174 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.51 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  29.46 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  26.34 
 
 
509 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  32.67 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  27.98 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.88 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  29.17 
 
 
3002 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  28.34 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  25.95 
 
 
510 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.83 
 
 
341 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  28.34 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  24.87 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.55 
 
 
530 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.67 
 
 
584 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  29.1 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  28.72 
 
 
174 aa  48.5  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  27.32 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  26.09 
 
 
246 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  26.4 
 
 
375 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  24.02 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  32.63 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  24.18 
 
 
503 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.52 
 
 
510 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  24.61 
 
 
363 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  31.58 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  31.58 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  31.58 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  31.58 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  32.63 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  31.58 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  31.58 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  26.18 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  27.89 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  23.56 
 
 
329 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  23.56 
 
 
300 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  29.57 
 
 
518 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  22.99 
 
 
325 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  31.58 
 
 
240 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  31.58 
 
 
240 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  26.42 
 
 
518 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  22.99 
 
 
325 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  27.03 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  30.53 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  30.53 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  30.53 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  30.53 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  24.74 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  26.51 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  28.57 
 
 
243 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  28.43 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  28.57 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2213  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.8 
 
 
227 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0138908  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  23.33 
 
 
257 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  25.95 
 
 
251 aa  42  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  26.78 
 
 
222 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  25.67 
 
 
247 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  28.57 
 
 
239 aa  41.2  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  24.73 
 
 
259 aa  41.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  29.27 
 
 
242 aa  41.2  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>