60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4206 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  100 
 
 
531 aa  1070    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  55.11 
 
 
551 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  46.04 
 
 
538 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  46.01 
 
 
537 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  23.42 
 
 
514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  24.61 
 
 
526 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  23.99 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  23.99 
 
 
513 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.95 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  23.66 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  23.9 
 
 
513 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  23.9 
 
 
513 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  23.9 
 
 
513 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  23.81 
 
 
513 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  23.9 
 
 
491 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  27.31 
 
 
510 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  24.2 
 
 
520 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  26.96 
 
 
503 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  24.37 
 
 
510 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  22.67 
 
 
523 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.55 
 
 
508 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.55 
 
 
508 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  24.57 
 
 
509 aa  90.9  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.11 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  32.32 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  23.65 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  28.89 
 
 
236 aa  63.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  30.62 
 
 
225 aa  60.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  24.89 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.15 
 
 
392 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  23.43 
 
 
382 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  28.79 
 
 
246 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  26.92 
 
 
253 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.6 
 
 
221 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  29.21 
 
 
250 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  27.13 
 
 
246 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  28.28 
 
 
242 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  30.94 
 
 
250 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  26.09 
 
 
202 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30 
 
 
391 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  25.81 
 
 
558 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.57 
 
 
474 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  26.09 
 
 
473 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  23.78 
 
 
207 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  21.71 
 
 
533 aa  47  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  24.77 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  30.51 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.29 
 
 
357 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  26.05 
 
 
475 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  29.18 
 
 
559 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  27.27 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  25.43 
 
 
255 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  27.08 
 
 
518 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  28.24 
 
 
229 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  27.84 
 
 
235 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 
1514 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.74 
 
 
244 aa  44.3  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  20.35 
 
 
251 aa  43.5  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  26.49 
 
 
458 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.89 
 
 
254 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>