271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06664 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  100 
 
 		 257 aa  533  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  88.33 
 
 		 240 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  67.65 
 
 		 240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  68.07 
 
 		 240 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  56.25 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  52.5 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  52.08 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  51.67 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  51.67 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  48.33 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  51.67 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  51.67 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  51.67 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  51.67 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  51.25 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  50.42 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  50.42 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  50.42 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  50.42 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  50.42 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  50 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  50.42 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  41.92 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  46.25 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  45.08 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  47.5 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  41.9 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  41.3 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  41.63 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  42.23 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  38.71 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  37.9 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  38.31 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  37.9 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.5 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.5 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  38.15 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  40.16 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  37.1 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.69 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  35.68 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  35.68 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  37.8 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  36.95 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  37.55 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  35.37 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  40.26 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  34.96 
 
 		 248 aa  142  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  34.68 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  36.9 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  34.39 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  34.96 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  33.33 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  33.61 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  38.02 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  36.71 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  35.68 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  35.82 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  31.17 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  30.88 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  33.77 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  30.04 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  34.63 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  31.19 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  30.86 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  32.14 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  33.84 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  28.46 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  32.24 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  27.94 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.95 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  29.2 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  32.64 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  29.2 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.6 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.03 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  28.06 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.28 
 
 		 170 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  37.29 
 
 		 167 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.73 
 
 		 167 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  35.76 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.74 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30.59 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  29.79 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.11 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.28 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.52 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.57 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.48 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.36 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.14 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  32.73 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.95 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.06 
 
 		 186 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.74 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.65 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.63 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>