More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0381 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  100 
 
 		 246 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  96.75 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  77.64 
 
 		 246 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  43.5 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  32.79 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  33.47 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  31.69 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  32.1 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  32.41 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  32.48 
 
 		 285 aa  128  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  34.06 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  36.04 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  33.33 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  28.89 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  29.33 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.78 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  29.96 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  29.78 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  28.89 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  29.33 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  29.96 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  34.38 
 
 		 273 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.52 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.52 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  30.16 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  34.78 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  31.7 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  33.69 
 
 		 265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  33.98 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  28 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  28.05 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  32.89 
 
 		 288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  38.1 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  29.76 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  30.16 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  27.17 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  32.11 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  30.4 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  30.4 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  30.4 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  28.8 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  30.4 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  30.4 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  30.4 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  28.11 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.83 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  30.4 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  30.4 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  30.4 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  33.5 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  29.96 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  29.2 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  32.56 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  28.16 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  28.5 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  28.5 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  31.31 
 
 		 304 aa  96.3  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  32.43 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  30.24 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  30.8 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  34.8 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  31.05 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  28.8 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  28.8 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  28.8 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  28.8 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  28.57 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.52 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  35.64 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  30.67 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.05 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  28.4 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  29.91 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  28.8 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  30.05 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  28.19 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  28.43 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  29.35 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  29.94 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  28.65 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.94 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.21 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  31.9 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.52 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.68 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.16 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.65 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  32.32 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1861  nitroreductase  28.89 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.27 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.11 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.89 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  27.71 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.99 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  27.11 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.66 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.75 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.72 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  26.32 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>