144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1770 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  44.08 
 
 
245 aa  223  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  31.43 
 
 
240 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  30.61 
 
 
240 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  30.61 
 
 
240 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  30.61 
 
 
240 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  30.49 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  30.49 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  30.49 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  30.49 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  30.61 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  29.03 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  32.11 
 
 
240 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  32.11 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  32.11 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  32.11 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  32.11 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  31.33 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  31.05 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  29.44 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  27.82 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  30.89 
 
 
240 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  31.36 
 
 
246 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  24.8 
 
 
244 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  28.46 
 
 
257 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  27.64 
 
 
240 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  25.2 
 
 
244 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  24.8 
 
 
244 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  24.59 
 
 
244 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.8 
 
 
244 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  24.4 
 
 
244 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  24 
 
 
244 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24 
 
 
244 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24 
 
 
244 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  24 
 
 
244 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  28.11 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  27.31 
 
 
243 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  28.92 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  25.7 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  28.51 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  30.22 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  27.38 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  30.67 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  30.22 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  28.87 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  28.46 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  29.49 
 
 
240 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  28.51 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  28.74 
 
 
273 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.64 
 
 
251 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  28.39 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  27.04 
 
 
299 aa  82  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  24.44 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  29.28 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  21.14 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.94 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  24.42 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  24.71 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  24.71 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  26.39 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  27.75 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  27.45 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  27.34 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  24.81 
 
 
273 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  25.78 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  29.91 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  26.59 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  24.39 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  26.19 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  25.21 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  25.48 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  25.93 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  26.92 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.42 
 
 
165 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  23.65 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  23.17 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  23.76 
 
 
238 aa  58.5  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.15 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  25.33 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  25.23 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.78 
 
 
202 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  25.33 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  24.32 
 
 
171 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  42.37 
 
 
177 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.8 
 
 
206 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  24.14 
 
 
175 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  26.99 
 
 
201 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  20.92 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.08 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  26.04 
 
 
170 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.44 
 
 
184 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.29 
 
 
188 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.63 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.4 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  23.08 
 
 
171 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  24.08 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  20.62 
 
 
179 aa  49.7  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  24.14 
 
 
176 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  23.98 
 
 
163 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  20.54 
 
 
177 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>