197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2389 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  79.17 
 
 		 240 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  71.67 
 
 		 239 aa  350  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  67.5 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  69.58 
 
 		 240 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  69.58 
 
 		 240 aa  332  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  69.58 
 
 		 240 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  69.58 
 
 		 240 aa  332  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  72.08 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  69.17 
 
 		 240 aa  330  8e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  69.17 
 
 		 240 aa  330  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  73.33 
 
 		 240 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  73.33 
 
 		 240 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  73.33 
 
 		 240 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  73.33 
 
 		 240 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  69.17 
 
 		 240 aa  328  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  69.17 
 
 		 240 aa  328  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  69.17 
 
 		 240 aa  327  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  72.92 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  59.58 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  47.08 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  50 
 
 		 240 aa  238  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  49.58 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  46.25 
 
 		 257 aa  231  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  45.06 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  42.04 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  44.67 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  39.92 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  43.25 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  37.31 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  38.27 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  38.37 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  38.62 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  38.62 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  38.37 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  37.14 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  36.73 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.33 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.33 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.33 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.92 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.92 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  35.92 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  35.92 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  37.75 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  34.8 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  34.29 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  41.37 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  34.68 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  39.78 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  36.55 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  34.82 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  33.86 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  38.69 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  32 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  35.71 
 
 		 286 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  36.65 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  30.89 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  35.27 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  39.09 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  41.12 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  32.66 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  40.64 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  39 
 
 		 284 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  35.75 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  31.2 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  35.92 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  30.8 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  40.34 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  34.39 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  44.15 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  39.46 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  31.33 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  40.38 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  26.32 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  28.88 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  37.1 
 
 		 274 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.7 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  38.46 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  33.16 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  24.4 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  34.55 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.51 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.9 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.58 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30.67 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.54 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.68 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.12 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.47 
 
 		 197 aa  62  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1861  nitroreductase  28.51 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.91 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.98 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.3 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.89 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  21.93 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.29 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  25 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>