229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2490 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  57.3 
 
 		 273 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  51.13 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  50.18 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  55.85 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  51.52 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  54.37 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  53.61 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  49.24 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  54.72 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  47.83 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  44.12 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  47.81 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  49.38 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  36.11 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  40.71 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  36.9 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  35.41 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  35.8 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  36.4 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  36.11 
 
 		 244 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  39.91 
 
 		 240 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  36.51 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  35.71 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  38.12 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  35.71 
 
 		 244 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.32 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  35.6 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  35.6 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  35.6 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  35.57 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.2 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.2 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  34.52 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  36.45 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  35.32 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  32.41 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  34.92 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  36.4 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  36.4 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  35.16 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  31.39 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  34.98 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  35.75 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  35.75 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  35.75 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  36.2 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  36.45 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  35.75 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  35.75 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  35.75 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  35.75 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  34.84 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  36.2 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  36.2 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  36.2 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  36.2 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  34.3 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  35.75 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  37.1 
 
 		 240 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  35.12 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  35.74 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  35.64 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  35.64 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  24.8 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  34.1 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  27.35 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  30.74 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  35.05 
 
 		 316 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  28.51 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  28.89 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.72 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  35.75 
 
 		 238 aa  92  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  33.69 
 
 		 317 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  27.32 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  29.91 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  34.64 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  28.81 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  24.77 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.98 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  36.24 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  33.14 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.69 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.49 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.63 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.88 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.73 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  26.32 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.45 
 
 		 163 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.73 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  36.64 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.43 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.57 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.63 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  26.83 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  32.48 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.21 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  26.71 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.32 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>