127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1560 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  100 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  48.79 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  39.84 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  40.79 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  38.65 
 
 		 299 aa  168  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  33.87 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  35.19 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  35.19 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  31.3 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  34.29 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  35.19 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  34.29 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  35.56 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  33.03 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  32.91 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  30.32 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  30.7 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  30.32 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  29.92 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  28.95 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  28.95 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  28.95 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  33.33 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  29.69 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.51 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.51 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  33.74 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.95 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  33.63 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  31.6 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  31.39 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  125  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  33.47 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  34.14 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  32.65 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  34.15 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  34.15 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  34.15 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  34.15 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  32.24 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  31.55 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  34.15 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  31.84 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  31.84 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  31.84 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  31.84 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  31.84 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  31.84 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  32.52 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  31.22 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  28.34 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  29.72 
 
 		 273 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  30.99 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  26.32 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  29.76 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  32.13 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  31.93 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  29.32 
 
 		 286 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  29.53 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  29.31 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  32.02 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  28.22 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  28.81 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  30.68 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  28.88 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  30.1 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  31.37 
 
 		 304 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  27.01 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  36.15 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  26.87 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  26.99 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  30.09 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  26.84 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  29.95 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.46 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  33.07 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  27.57 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  25.35 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  31.92 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  26.92 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  25.93 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  28.42 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.95 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  26.42 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  23.18 
 
 		 175 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  26.2 
 
 		 171 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.14 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  26.37 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.9 
 
 		 180 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.27 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  20.59 
 
 		 170 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.96 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  22.16 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  25.71 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  23.2 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.38 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  23.53 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>