More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3290 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  64.04 
 
 		 274 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  55.83 
 
 		 286 aa  285  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  55.26 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  54.31 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  51.91 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  55.56 
 
 		 273 aa  254  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  47.55 
 
 		 273 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  55.82 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  53.53 
 
 		 273 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  50.18 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  51.5 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  53.14 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  51.31 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  37.7 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  40 
 
 		 243 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  38.37 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  36.21 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.57 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  35.97 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  36.65 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  35.8 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  35.8 
 
 		 244 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  35.8 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  35.95 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.39 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  40.4 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.39 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  36.21 
 
 		 244 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  36.33 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  34.39 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  34.57 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  34.26 
 
 		 240 aa  142  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  38.05 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  38.05 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  38.05 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  38.05 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  38.05 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  38.05 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  38.05 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  38.54 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  38.61 
 
 		 240 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  40.98 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  40.98 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  40.98 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  40.98 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  31.15 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  40.49 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  33.78 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32.66 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  35.41 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  36.95 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  31.98 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  31.98 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  32.52 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  31 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  41.29 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  34.83 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  34.52 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  25.74 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  39 
 
 		 240 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  36.55 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  28.22 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  33.5 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  36.62 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  36.44 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  32.99 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  36.11 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  30.95 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.7 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.92 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  32.11 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  34.1 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  31.09 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  30.94 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  33.68 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.7 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.53 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.47 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.06 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  31.48 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  27.45 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  38.46 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.57 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.86 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.63 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  35.62 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  29.27 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.81 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.02 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.53 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  34.46 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  29.35 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  35.63 
 
 		 173 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.25 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  28.57 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.22 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.22 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.44 
 
 		 186 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>