150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1502 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  65.61 
 
 
299 aa  343  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  42.35 
 
 
248 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  42.22 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  40.79 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  36.32 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.23 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  35.24 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  31.2 
 
 
253 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  37.17 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  33.48 
 
 
251 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  33.48 
 
 
251 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  34.26 
 
 
243 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  35.89 
 
 
239 aa  121  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  32.69 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  34.06 
 
 
240 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  35.74 
 
 
240 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  35.74 
 
 
240 aa  118  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  35.74 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  35.74 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  35.48 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  35.48 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  35.48 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  35.48 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  33.77 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  35.34 
 
 
240 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  32.72 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  33.33 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  30.38 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  30.38 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  30.38 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  31.14 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.38 
 
 
244 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.96 
 
 
244 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  33.59 
 
 
273 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.96 
 
 
244 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  32.11 
 
 
244 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  32.52 
 
 
244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  33.18 
 
 
244 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  31.87 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  34.96 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  35.89 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  28.19 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  34.96 
 
 
240 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  34.96 
 
 
240 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  34.96 
 
 
240 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  34.96 
 
 
240 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  31.15 
 
 
317 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  37.22 
 
 
246 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  31.06 
 
 
269 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  31.38 
 
 
242 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
285 aa  101  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  34.4 
 
 
273 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  33.62 
 
 
240 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  32.95 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  32.82 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  29.91 
 
 
316 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  32.56 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  32.26 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  37.21 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  36.02 
 
 
273 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  31.41 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  34.22 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  30.14 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  30.21 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  34.47 
 
 
304 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  33.49 
 
 
253 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  36.04 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  31.92 
 
 
288 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  27.16 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  34.1 
 
 
284 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  33.51 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  40.13 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  32.24 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  26.59 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  34.73 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.49 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  31.63 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  25.78 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  28.81 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  29.35 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  27.08 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  31.69 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.52 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.41 
 
 
168 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.75 
 
 
179 aa  56.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.93 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.76 
 
 
177 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  27.65 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.3 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.6 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.04 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.13 
 
 
186 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.11 
 
 
206 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  31.18 
 
 
173 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.08 
 
 
184 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.49 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.45 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.45 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  26.9 
 
 
175 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>