More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  59.25 
 
 
273 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  54.07 
 
 
273 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  55.11 
 
 
273 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  47.6 
 
 
273 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  52.63 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  51.31 
 
 
288 aa  238  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  52.59 
 
 
276 aa  234  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  51.31 
 
 
284 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  53.61 
 
 
274 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  53.7 
 
 
273 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  52.08 
 
 
274 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  51.6 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  53.65 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  38.52 
 
 
285 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  39.27 
 
 
261 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  37.86 
 
 
244 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  39.2 
 
 
248 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  43.44 
 
 
243 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  37.45 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  36.63 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  36.21 
 
 
244 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  37.66 
 
 
251 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.21 
 
 
244 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  36.63 
 
 
244 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  36.63 
 
 
244 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.21 
 
 
244 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.8 
 
 
244 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.21 
 
 
244 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.21 
 
 
244 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  35.68 
 
 
244 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  40.52 
 
 
249 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  36.36 
 
 
251 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  35.89 
 
 
240 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  35.53 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  34.63 
 
 
257 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  36.57 
 
 
251 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  33.87 
 
 
250 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  36.57 
 
 
251 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  37.83 
 
 
240 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  36.32 
 
 
246 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  34.82 
 
 
240 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  34.82 
 
 
240 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  34.82 
 
 
240 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  34.82 
 
 
240 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  39.22 
 
 
239 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  37.26 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  35.87 
 
 
246 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  37.07 
 
 
239 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  34.78 
 
 
240 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  34.41 
 
 
240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  34.41 
 
 
240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  34.41 
 
 
240 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  34.82 
 
 
240 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  38.53 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  32.33 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  34.41 
 
 
240 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  42.13 
 
 
240 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  39.62 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  39.62 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  39.62 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  39.62 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  40.34 
 
 
240 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  36.14 
 
 
240 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  36.02 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  32.53 
 
 
248 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  32.25 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  39.89 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  32.16 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  31.11 
 
 
240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  37.63 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  35.29 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  38.62 
 
 
238 aa  108  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.58 
 
 
299 aa  105  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  31.92 
 
 
253 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  34.25 
 
 
282 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.44 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  30.77 
 
 
215 aa  86.3  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.27 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  38.46 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.38 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  37.67 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  25.31 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  36.42 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.99 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  25.76 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.05 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  28.33 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27 
 
 
186 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.27 
 
 
169 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1861  nitroreductase  33.33 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  33.9 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32.22 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.82 
 
 
179 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  31.25 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  32.45 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.82 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.66 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.27 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.33 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>