219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2745 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  99.17 
 
 
240 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  99.17 
 
 
240 aa  494  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  99.17 
 
 
240 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  99.17 
 
 
240 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  99.17 
 
 
240 aa  494  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  98.75 
 
 
240 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  97.92 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  84.17 
 
 
240 aa  437  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  87.5 
 
 
240 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  87.5 
 
 
240 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  87.5 
 
 
240 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  87.5 
 
 
240 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  87.08 
 
 
240 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  69.17 
 
 
240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  65.83 
 
 
239 aa  327  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  67.92 
 
 
239 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  68.75 
 
 
240 aa  316  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  59.17 
 
 
242 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  51.67 
 
 
257 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  50.83 
 
 
240 aa  255  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  51.67 
 
 
240 aa  248  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  52.08 
 
 
240 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  42.45 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  43.48 
 
 
253 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  43.03 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  40 
 
 
269 aa  211  9e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  39.59 
 
 
248 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  40.55 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  38.84 
 
 
251 aa  178  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  36.93 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  36.99 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  36.99 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  35.92 
 
 
244 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  36.51 
 
 
244 aa  168  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  36.1 
 
 
244 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.1 
 
 
244 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.1 
 
 
244 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.1 
 
 
244 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.1 
 
 
244 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.51 
 
 
244 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  36.1 
 
 
244 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  34.69 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  34.96 
 
 
251 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  37.1 
 
 
248 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  32.8 
 
 
250 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  35.86 
 
 
273 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  37.35 
 
 
273 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  36.8 
 
 
246 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  38.05 
 
 
284 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  38.07 
 
 
286 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  39.64 
 
 
273 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  36.36 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  35 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  36.95 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  35.74 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  36.7 
 
 
304 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  31.84 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  39.36 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  30.61 
 
 
247 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  38.24 
 
 
274 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  39.04 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  35.29 
 
 
316 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  36.79 
 
 
273 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  31.82 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  36.07 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  34.78 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  32.3 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  35.19 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  33.95 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  33.52 
 
 
238 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  30.4 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  32.14 
 
 
253 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  37.57 
 
 
265 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  34.67 
 
 
282 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  29.6 
 
 
246 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.46 
 
 
245 aa  102  8e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  31.13 
 
 
238 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  29.92 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.5 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  33.16 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  35.76 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.59 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.89 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.53 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.25 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.72 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.8 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.38 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.73 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  26.67 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.32 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  26.82 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.24 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.6 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.92 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.97 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.06 
 
 
194 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.77 
 
 
186 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>