193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1955 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  94.56 
 
 		 239 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  71.67 
 
 		 240 aa  343  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  66.25 
 
 		 240 aa  343  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  70.42 
 
 		 240 aa  320  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  65.83 
 
 		 240 aa  318  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  65.83 
 
 		 240 aa  318  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  65.83 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  65.42 
 
 		 240 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  65.42 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  65.42 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  65.42 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  65.42 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  65.42 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  66.25 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  66.25 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  66.25 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  66.25 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  65.83 
 
 		 240 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  51.25 
 
 		 240 aa  244  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  50.42 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  49.17 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  52.08 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  47.5 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  43.31 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  40.82 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  42.21 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  35.91 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  40.24 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  40.08 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  37.45 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  37.45 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  36.07 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  37.8 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  35.27 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  35.12 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  35.39 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  34.71 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.3 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  34.44 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  34.44 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  34.44 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.02 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.02 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  33.74 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  35.32 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  39.52 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  36.89 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  35.86 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  35.75 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 		 285 aa  132  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  35.89 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  37.39 
 
 		 273 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  38.81 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  34.96 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  31.22 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  31.05 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  36.7 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  40.27 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  37.27 
 
 		 276 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  33.06 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  38.3 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  37.07 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  34.98 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  32.65 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  34.07 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  36.55 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  30.94 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  38.92 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  36.7 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  29.8 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  29.02 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  29.08 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  32.12 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  31.11 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  34.3 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  33.79 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  32.99 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  30.85 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  32.97 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  33.33 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  33.33 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.91 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.87 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  26.52 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.29 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30.25 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.85 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.86 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  26.16 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.29 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.14 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  31.1 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.26 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.05 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.32 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  22.86 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  25 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  22.53 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>