More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7190 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  60.24 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  55.56 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  55.82 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  55.12 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  50 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  54.72 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  51.81 
 
 		 286 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  53.6 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  52.4 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  50.79 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  47.83 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  49.59 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  51.6 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  37.85 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  35.06 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  35.46 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  36.25 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  35.46 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.46 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  35.06 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.66 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.66 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  34.27 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  34.52 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  32.53 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  34.66 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  34.26 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  32.47 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  32.68 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  35.06 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  36.53 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  35.27 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  35.19 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  31.17 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  37.18 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  33.73 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  27.92 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  33.33 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  32.13 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  37.38 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  37.86 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  35.84 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  38.1 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  34.26 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  31.72 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  28.69 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  28.91 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  34.98 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  32.14 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  30.99 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  30.99 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  35.27 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  32.14 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  32.14 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  32.24 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  32.14 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  31.18 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  32.14 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  32.14 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  32.14 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  32.14 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  32.14 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  34.38 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  34.38 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  34.38 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  34.38 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  34.08 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  33.93 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  33.07 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  32.57 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  28.74 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  33.49 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  28.69 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  29.39 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  30.81 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  30.81 
 
 		 317 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  26.86 
 
 		 316 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  38.03 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  30.17 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  26.59 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.46 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  25.82 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  28.98 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.63 
 
 		 176 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  26.21 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.35 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.73 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.56 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.12 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  32.2 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.94 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.79 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.41 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  30.06 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.72 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.54 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.27 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.93 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.89 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>