230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2300 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  100 
 
 		 317 aa  644    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  69.03 
 
 		 316 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  46.37 
 
 		 270 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  40.51 
 
 		 238 aa  175  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  38.82 
 
 		 238 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  43.52 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  34.47 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  39.09 
 
 		 244 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  33.19 
 
 		 244 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.19 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.19 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  33.19 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  33.19 
 
 		 244 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  33.62 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  33.19 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  32.34 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.77 
 
 		 244 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  38.82 
 
 		 238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  32.18 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  32.18 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.63 
 
 		 240 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  29.65 
 
 		 261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  34.29 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  30.88 
 
 		 257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  37.36 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  36.93 
 
 		 273 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  35.33 
 
 		 240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  33.16 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  35.33 
 
 		 240 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  30.61 
 
 		 240 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  28.87 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  29.15 
 
 		 243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  33.04 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  34.78 
 
 		 240 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  34.78 
 
 		 240 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  33.04 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  33.04 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  33.04 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  33.04 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  34.78 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  30.54 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  34.78 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  34.78 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  34.78 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  34.78 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  37.69 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  31.75 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  36.65 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  31.15 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  33.15 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  29.31 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  32.65 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  33.16 
 
 		 239 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  37.5 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  30.36 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  27.81 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  33.68 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  35.89 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  33.48 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  34.06 
 
 		 276 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  29.74 
 
 		 240 aa  89.7  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  29.44 
 
 		 246 aa  89.4  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  34.89 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  30.17 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  31.38 
 
 		 245 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  29.95 
 
 		 246 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  28.35 
 
 		 248 aa  86.3  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  35.08 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  34.48 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  28.43 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  28.43 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  27.75 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  29.44 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  30.94 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  32 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.62 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  32.95 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  30.11 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  33.71 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  32.09 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.62 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.96 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 163 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  33.69 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.4 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.17 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  26.09 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  24.73 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.82 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  23.65 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  23.49 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  22.67 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  22.41 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.29 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.53 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.29 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>