More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1633 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  100 
 
 		 238 aa  476  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  68.35 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  69.2 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  70.94 
 
 		 238 aa  291  9e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  42.62 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  41.77 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  33.33 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  33.33 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.92 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.92 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  32.08 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  32.08 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  31.25 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.67 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  31.67 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  34.54 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  37.22 
 
 		 261 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  36.56 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  36.56 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  37.39 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  37.63 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  35.56 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  35.38 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  35.36 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  33.33 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  32.86 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  33.13 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  32.4 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  30.77 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.77 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  33.19 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  29.53 
 
 		 250 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  32.7 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  32.7 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  32.7 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  32.61 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  34.21 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  33.66 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  31.92 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  34.26 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  32.04 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  35.52 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  31.49 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  34.33 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  35.05 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  36.07 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  35.71 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  31.38 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  32.7 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  31.25 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  34.52 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  31.71 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  31.79 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  34.95 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  34.78 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  28.51 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  27.27 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  38.98 
 
 		 304 aa  95.1  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  36.54 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  33.87 
 
 		 286 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  26.56 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.69 
 
 		 170 aa  88.6  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  30.77 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  27.47 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  32.26 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  27.47 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.05 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  35.39 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  30.25 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.57 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  34 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.72 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.81 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.67 
 
 		 174 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.63 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.47 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  26.37 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  32.29 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.04 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.2 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.92 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.49 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.74 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.66 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.36 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  29.88 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.97 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>