More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1372 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  60.07 
 
 		 273 aa  312  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  55.51 
 
 		 273 aa  301  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  64.29 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  60.67 
 
 		 276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  55.15 
 
 		 284 aa  265  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  56.55 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  54.51 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  55.64 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  55.85 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  52.81 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  55.11 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  53.6 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  54.18 
 
 		 304 aa  221  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  42.04 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  37.35 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  42.86 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  36.65 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  38.43 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  36.55 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  37.85 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  39 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  37.85 
 
 		 244 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  38.31 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  38.4 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.4 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  41.05 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  38 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  38 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  38.84 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.6 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.6 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  38.13 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  35.6 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  40.28 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  35.32 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  37.65 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  34.66 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  39.64 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  39.64 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  40.09 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  39.64 
 
 		 240 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  33.5 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  39.64 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  29.85 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  39.46 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  39.46 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  39.46 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  39.46 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  41.7 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  41.7 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  41.7 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  41.7 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  36.61 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  33.33 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  38.64 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  35.19 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  33.33 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  41.26 
 
 		 240 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  40.45 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  34.38 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  34.38 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  41.89 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  36.84 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  37.67 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  37.61 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  40 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  35.89 
 
 		 317 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  30.17 
 
 		 240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  29.81 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  33.5 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  33.94 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  32.93 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.38 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  29.64 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  30.05 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  28.39 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  26.48 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  33.51 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.18 
 
 		 170 aa  86.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.66 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  35.26 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.26 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.29 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  36.96 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  30.93 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.87 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.46 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  27.22 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.98 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  37.06 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.9 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.07 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  31.58 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.12 
 
 		 214 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.41 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.95 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  35.96 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  26.4 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>