More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1230 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  34.68 
 
 
251 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  35.19 
 
 
246 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  28.8 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.8 
 
 
244 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.8 
 
 
244 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  29.2 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  28.4 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  28.4 
 
 
244 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  28.4 
 
 
244 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  28.4 
 
 
244 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28 
 
 
244 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  28.4 
 
 
244 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  28.11 
 
 
248 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  27.67 
 
 
273 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  29.8 
 
 
244 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  30.19 
 
 
246 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  29.6 
 
 
240 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  32.26 
 
 
249 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  24.88 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  26.4 
 
 
244 aa  98.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  30.84 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  27.6 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  28.44 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  27.48 
 
 
273 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  25.35 
 
 
243 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  27.52 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  29.03 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  28.57 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  29.05 
 
 
316 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  27.6 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  28.35 
 
 
317 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  27.6 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  27.6 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  27.6 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  27.6 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  28.4 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  29.49 
 
 
288 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  25.46 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  26.48 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  27.02 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  26.92 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  27.48 
 
 
276 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  25.7 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  25 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  30.4 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  25.5 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  23.79 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  26.82 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  25.5 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  25.5 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  25.5 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  25.5 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  25.5 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  24.7 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  30.43 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  25.1 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  25.5 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  25.94 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  23.77 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  26.53 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  25 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  24.4 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  25.49 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.51 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  23.77 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.86 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  23.39 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  27.03 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  31.86 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  30.32 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  25.1 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  31.37 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  25.37 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  24.64 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  30.88 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.47 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  23.58 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.89 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  23.58 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  27.27 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  29.69 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  24.06 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  32.19 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.65 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.47 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.62 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  26.87 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  23.9 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  26.4 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.34 
 
 
197 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  26.92 
 
 
182 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.43 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  25.65 
 
 
169 aa  63.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.79 
 
 
180 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  23.9 
 
 
282 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
184 aa  62  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1861  nitroreductase  29.03 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  24.77 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>