199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0979 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  99.58 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  84.17 
 
 		 240 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  87.92 
 
 		 240 aa  430  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  88.33 
 
 		 240 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  87.92 
 
 		 240 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  87.92 
 
 		 240 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  87.92 
 
 		 240 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  87.5 
 
 		 240 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  87.92 
 
 		 240 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  87.5 
 
 		 240 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  87.92 
 
 		 240 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  73.33 
 
 		 240 aa  338  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  72.5 
 
 		 240 aa  321  8e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  66.25 
 
 		 239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  67.92 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  57.92 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  50.42 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  50.42 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  50 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  48.75 
 
 		 240 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  42.45 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  43.44 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  40 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  40.71 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  38.62 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  41.43 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  37.8 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  39.67 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  37.55 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  37.8 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.99 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.99 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  36.99 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  37.4 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  37.4 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.99 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.99 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  36.99 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  36.73 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  36.73 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  35.86 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  36.18 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  38.71 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  38.96 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  36.82 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  36.29 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  40.98 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  34.15 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  36.9 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  37.1 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  38.01 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  41.7 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  37.75 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  32.11 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  34.96 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  37.31 
 
 		 316 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  33.18 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  39.29 
 
 		 273 aa  121  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  39.89 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  39.22 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  33.04 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  37.38 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  39.62 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  34.38 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.28 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  36.53 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  31.92 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  35.68 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  33.8 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  37.71 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  31.91 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  28.8 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  28.1 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  28.97 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.6 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  32.38 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  26.02 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  33.16 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.65 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.95 
 
 		 192 aa  72  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  34.16 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.01 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.1 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.16 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.32 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.55 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.89 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.37 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.27 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.38 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.57 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.8 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1861  nitroreductase  28.5 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.77 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.61 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30.19 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>