161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8680 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  100 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  48.99 
 
 		 265 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  33.05 
 
 		 248 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  34.14 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  31.62 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  30.08 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  33.6 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  37.37 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  29.27 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  28.86 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  29.27 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  29.27 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  29.27 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  28.86 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  29.39 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  40.99 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  34.29 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  28.51 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  27.82 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  28.11 
 
 		 246 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  27.94 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  27.53 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  27.78 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  29.96 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  27.31 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  27.31 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  30.28 
 
 		 240 aa  99  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  34.67 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  34.67 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  34.67 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  34.67 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  34.67 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  34.67 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  30.49 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  34.67 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  36.44 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  34.17 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  34.67 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  31.1 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  30.53 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  33.47 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  35.68 
 
 		 240 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  35.68 
 
 		 240 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  35.68 
 
 		 240 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  35.68 
 
 		 240 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  35.29 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  36.6 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  35.18 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  32.37 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  26.84 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  24.48 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  26.53 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  33.66 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  36.73 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  27.75 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  34.26 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  34.25 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  29.53 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  34.77 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  32.93 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  30.25 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  20.99 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  25.35 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  25.82 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  27.31 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  34.57 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  23.39 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  23.24 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  27.08 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  24.31 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  24.31 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.02 
 
 		 192 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  33.74 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  32.26 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  34.23 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  32.9 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  23.9 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  29.78 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  23.17 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.72 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  28.71 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  26.44 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.86 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.67 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.66 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.42 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.67 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  23.2 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  25.91 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.06 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.16 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.41 
 
 		 170 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  30.77 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.72 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  24.4 
 
 		 169 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  34 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>