More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1357 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  81.25 
 
 		 215 aa  354  5.999999999999999e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  59.47 
 
 		 329 aa  234  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  37.5 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.54 
 
 		 170 aa  92.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.56 
 
 		 194 aa  91.3  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.56 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.35 
 
 		 175 aa  89.4  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.99 
 
 		 174 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.65 
 
 		 178 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.57 
 
 		 176 aa  85.1  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.4 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  30.18 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  29.24 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.21 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.79 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.72 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.89 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.72 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.87 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  34.44 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.09 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  31.94 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  27.62 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.52 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  25.73 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  31.58 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.34 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.44 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.93 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.14 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  28.41 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  30.59 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.32 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.55 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.05 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.32 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.21 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.71 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  29.38 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  29.41 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.29 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  33.61 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  27.17 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.65 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.48 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.71 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  30.59 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  27.54 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  30.64 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.37 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  28.87 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.38 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  29.17 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.82 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.29 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  26.29 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.83 
 
 		 172 aa  62  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.29 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  33.55 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30.06 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  28.57 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  26.26 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  28.31 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  29.94 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.93 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  27.5 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.9 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.67 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.6 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  29.35 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  27.01 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  31.76 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.73 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.43 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  26.11 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  26.29 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.29 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.06 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.98 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  27.54 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  24.28 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  30.95 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  31.52 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  27.91 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  30.15 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  26.86 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.25 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.79 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.32 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  31.1 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  28.31 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.21 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  27.91 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  24.7 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  24.04 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  29.07 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  27.92 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>