More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0664 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  100 
 
 		 180 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  39.57 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  39.34 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  39.56 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  36.9 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  38.15 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  35.03 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  36.02 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.64 
 
 		 194 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.07 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.07 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.07 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.91 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.11 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  32.39 
 
 		 175 aa  97.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.93 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.11 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  30.22 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.82 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.29 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  32.12 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.94 
 
 		 163 aa  87.8  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.68 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  29.51 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.93 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  26.35 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.48 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.94 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  31.84 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.93 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.22 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  31.35 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.33 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.89 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.33 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  30.86 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  30.48 
 
 		 239 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.94 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.17 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  29.94 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.89 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.17 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.97 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  28.99 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  28.98 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  28.82 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  31.14 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.8 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  31.74 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  26.42 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  33.13 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.41 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.21 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.24 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  31.07 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28.92 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  24.1 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.48 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  33.33 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.03 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  27.72 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.57 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.01 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.27 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  30.49 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.43 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.42 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.01 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.57 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.67 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.24 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.26 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  29.88 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.9 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.78 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.31 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.31 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  25.52 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.48 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  25.95 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.34 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  30.32 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.91 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  26.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  28.92 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  28.65 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  29.1 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.41 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.09 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  31.17 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.34 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  26.44 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.65 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.78 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  26.74 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  27.91 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.45 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>