253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2607 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  100 
 
 		 253 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  52 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  53.2 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  43.87 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  43.48 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  43.48 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  43.48 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  43.08 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  43.08 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  43.08 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  41.9 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.69 
 
 		 244 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.69 
 
 		 244 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  43.08 
 
 		 244 aa  224  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  41.57 
 
 		 244 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  41.9 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  40.71 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  46.8 
 
 		 242 aa  208  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  42.58 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  43.48 
 
 		 240 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  43.48 
 
 		 240 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  39.92 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  42.69 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  42.69 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  42.69 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  43.08 
 
 		 240 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  42.69 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  45.06 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  43.08 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  42.69 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  38.82 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  43.31 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  38.82 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  43.87 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  39.06 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  43.2 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  40.71 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  40.71 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  40.71 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  40.71 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  39.42 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  40.32 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  40 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  41.11 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  31.82 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  37.35 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  32.55 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  36.73 
 
 		 248 aa  155  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  36.1 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  36.86 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  38.04 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  36.43 
 
 		 273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  37.67 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  31.01 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  33.85 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  33.07 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  29.44 
 
 		 265 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  36.72 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  32.41 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  33.46 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  35.71 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  32.02 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  31.2 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  37.45 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  35.41 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  34.76 
 
 		 316 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  31.39 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  31.62 
 
 		 282 aa  121  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  35.57 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  38.1 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  31 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.44 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  35.19 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  32.8 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  30.54 
 
 		 317 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.71 
 
 		 170 aa  99  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.24 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  28.51 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  27.6 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.57 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.04 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.49 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.06 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  33.33 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  34.95 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.51 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  33.57 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.9 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  23.77 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  27.43 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  32.37 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  26.47 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  30.65 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  32.12 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  24.46 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.86 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.11 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.41 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.65 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>