More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0115 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  100 
 
 
274 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  37.65 
 
 
169 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  40 
 
 
169 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  42.11 
 
 
173 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  38.82 
 
 
171 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  38.82 
 
 
171 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  40 
 
 
169 aa  125  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  38.82 
 
 
169 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  39.53 
 
 
174 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  40.35 
 
 
173 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  38.92 
 
 
166 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  38.92 
 
 
166 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  40.35 
 
 
173 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  40.85 
 
 
163 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  41.76 
 
 
169 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  37.72 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  38.6 
 
 
173 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  35.19 
 
 
169 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  38.01 
 
 
170 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  36.42 
 
 
169 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  35.96 
 
 
197 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  35.67 
 
 
201 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  36.47 
 
 
169 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.53 
 
 
165 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  36.26 
 
 
171 aa  99.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  32.74 
 
 
171 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  39.74 
 
 
170 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.07 
 
 
176 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  34.16 
 
 
169 aa  94.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  31.79 
 
 
187 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  34.15 
 
 
166 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.96 
 
 
174 aa  93.2  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.39 
 
 
186 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  40.91 
 
 
167 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  32.34 
 
 
167 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.52 
 
 
194 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.75 
 
 
186 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  41.14 
 
 
169 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.22 
 
 
184 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.26 
 
 
188 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  39.35 
 
 
167 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.22 
 
 
186 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.4 
 
 
194 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.91 
 
 
170 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  34.07 
 
 
184 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  34.08 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  32.48 
 
 
180 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.14 
 
 
173 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.94 
 
 
175 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.94 
 
 
192 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.4 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  31.61 
 
 
183 aa  82  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  33.56 
 
 
176 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.08 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.13 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  33.95 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.64 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.45 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  31.05 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  30.06 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.65 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  36.49 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  26.84 
 
 
189 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  33.12 
 
 
177 aa  79  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.9 
 
 
176 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.37 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.89 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.11 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.86 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.11 
 
 
202 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.81 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.37 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.95 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  27.43 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  30.29 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.41 
 
 
175 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.74 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.34 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.98 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  30.92 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  38.71 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.87 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  26.37 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.74 
 
 
169 aa  71.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.33 
 
 
180 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  27.63 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  33.56 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  36.42 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.12 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  30.77 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  29.19 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.05 
 
 
168 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  29.19 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.59 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  29.21 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  33.77 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.48 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  30.59 
 
 
175 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.94 
 
 
173 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>