More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0787 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  100 
 
 		 177 aa  356  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  62.28 
 
 		 173 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  56.65 
 
 		 172 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  60.37 
 
 		 178 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  56.63 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  54.22 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  50.31 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  46.82 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  44.71 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  47.65 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  31.14 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  38.03 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  35.8 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.33 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  37.97 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  40.52 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.29 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  43.59 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.55 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  43.1 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.81 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  40 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.67 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.24 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.43 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.57 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.78 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  31.58 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  40 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.24 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  34.48 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.73 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  41.03 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  33.91 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.76 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  35.96 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.77 
 
 		 274 aa  67.8  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  32.24 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.12 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  36.36 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  41.38 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.99 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.5 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  36.09 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  36.22 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  36.24 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.65 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  32.05 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  36.89 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  32.05 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.66 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.72 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  25.15 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  35.53 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.95 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  32.64 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  32.64 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.24 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  40.17 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  40.17 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  39.75 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  33.53 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  29.12 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.72 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  33.14 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  40.98 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.56 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  31.25 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  31.55 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  32.35 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.33 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.34 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.34 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.03 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.49 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.41 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  30.77 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  26.34 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.93 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.99 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.88 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  25 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  27.69 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  31.63 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  34.78 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.09 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  34.78 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  26.82 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.95 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  41.96 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  25.89 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.22 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.03 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  47.06 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.43 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.08 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  32.28 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>