More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2975 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  100 
 
 		 169 aa  345  1e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  76.92 
 
 		 169 aa  267  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  60.95 
 
 		 174 aa  225  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  52.1 
 
 		 176 aa  200  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  53.25 
 
 		 169 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  53.85 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  50.3 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  50.3 
 
 		 171 aa  184  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  50.3 
 
 		 171 aa  184  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  50.3 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  57.99 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  46.75 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  50 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  46.15 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  49.4 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  50 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  39.29 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  42.26 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  39.88 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  39.88 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  42.24 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  41.42 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  41.88 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  38.27 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  40.59 
 
 		 201 aa  133  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  40.48 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  41.36 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  37.87 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  39.41 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  41.76 
 
 		 274 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  39.38 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  36.59 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  35.98 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  34.5 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  40 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  37.97 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.42 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  37.85 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  40.76 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  35.67 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  35.09 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  38.42 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  36.94 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  37.85 
 
 		 194 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  32.2 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.58 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.01 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  32.05 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.29 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  33.33 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  33.96 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  32.12 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  31.21 
 
 		 175 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.03 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.14 
 
 		 214 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.14 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  35.95 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.45 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  34.3 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.33 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  37.91 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  33.92 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.48 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  36.25 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.99 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.99 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.74 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.84 
 
 		 584 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  30.77 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.64 
 
 		 178 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.07 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  31.45 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.77 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.54 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.89 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.41 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  35.47 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  34.52 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  32.18 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.05 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 867 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  31.03 
 
 		 351 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  33.33 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 411 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  31.03 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  30.29 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.25 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.12 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.56 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.86 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.65 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  33.14 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.44 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.06 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  34 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.56 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>